Причинами возникновения географического язык могут быть такие заболевания как аллергия, заболевание желудочно-кишечного тракта, нарушение обмена веществ, инфекционные заболевания, болезни поджелудочной железы, аутоиммунные заболевания, эндокринные нарушения.